Dự án Thủy điện Trung Sơn có nhiệm vụ chính là cung cấp điện cho hệ thống điện quốc gia, góp phần chống lũ về mùa mưa, cấp nước về mùa khô cho tỉnh Thanh Hóa, góp phần thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội địa phương và đảm bảo an ninh quốc phòng khu vực Tây Thanh Hóa.